SCIGRESS 3.1.9 (en)

(fot. www.scigress.com)

SCIGRESS Worksystem

SCIGRESS jest pakietem oprogramowania spełniającym wymagania naukowców prowadzących badania z zakresu chemii, biochemii, bioinformatyki oraz inżynierii materiałowej. Program znajduje zastosowanie w badaniach prowadzonych zarówno na uniwersytetach jak i w jednostkach badawczych firm chemicznych i farmaceutycznych. SCIGRESS umożliwia badanie różnych układów (cząsteczki organiczne i nieorganiczne, polimery, półprzewodniki, materiały ceramiczne oraz enzymy i białka) przy wykorzystaniu szeregu metod obliczeniowych, od mechaniki molekularnej do metod kwantowych (metody półempiryczne oraz DFT).
 

Specyfikacja techniczna programu

Możliwość analizy następujących materiałów:

  • Materiały i związki nieorganiczne (w tym metale, materiały ceramiczne, tlenki)
  • Materiały organiczne (w tym polimery)
  • Związki biologiczne w tym białka i enzymy
  • Ciecze, gazy, ciała stałe

Typy obliczeń:

  • Optymalizacja geometrii: minimum lokalne, minimum globalne, stany przejściowe
  • Obliczanie ładunków atomów, długości i rzędów wiązań
  • Analiza konformacyjna
  • Obliczanie właściwości termodynamicznych: entalpia, entropia, energia swobodna, ciepło tworzenia
  • Obliczanie i wizualizacja orbitali molekularnych
  • Obliczanie i analiza widm IR oraz UV-VIS
  • Obliczanie momentów dipolowych i kwadrupolowych cząsteczek, a także (hiper)polaryzowalności
  • Symulacja zjawisk zależnych od czasu

Metody obliczeniowe

  • Metoda DFT
  • Metody pół-empiryczne, w szczególności AM1, AM1d, PM3 oraz PM5, PM6
  • Liniowo skalowalne metody półempiryczne dla białek i układów biologicznych
  • Modele solwatacyjne
  • Mechanika molekularna
  • Dynamika molekularna
  • => Zastosowanie zewnętrznych pól siłowych: elektrostatycznego, magnetycznego, grawitacyjnego oraz tensora naprężeń zewnętrznych
  • => Kontrola zmiany ciśnienia oraz temperatury w trakcie symulacji
  • => Dodawania atomów/cząsteczek do układu w trakcie symulacji
  • Pola siłowe:
  • => Dwuciałowe: Born-Mayer-Huggins, Erkoc, Johnson, Kawamura, Lennard-Jones, Morse
  • => Trójciałowe: Justo, Marks, Stillinger-Weber, Tersoff
  • => Wielociałowe: Ackland, Finnis-Sinclair, Grujicic-Zhou, Oh-Johnson, Rosato-Guillop-Legrand, Voter-Chen, Yang-Johnson

Interfejs graficzny z następującą funkcjonalnością:

  • Tworzenie cząsteczek, wizualizacja wyników, uruchamianie obliczeń z poziomu interfejsu graficznego
  • Analiza białek: sekwencja, topologia, analiza centrum aktywnego
  • Automatyczne dokowanie oraz „scoring” ligandów do centrum aktywnego białka
  • Interfejs do zautomatyzowanych obliczeń na dużych bibliotekach cząsteczek, z możliwością tworzenia modeli QSAR
  • Tworzenia komórek elementarnych materiałów w stanie krystalicznym, amorficznym, polimerów, dendrymerów, materiałów ciekłokrystalicznych
  • Tworzenia komórek zawierających mieszaniny związków chemicznych w fazie ciekłej oraz gazowej
  • Moduły graficzne do analizy wyników symulacji:
  • => Analiza ruchu składników układ
  • => Moduł do prezentacji w formie wykresu parametrów termodynamicznych, takich jak temperatura, ciśnienie, energia wewnętrzna, energia kinetycznej i potencjalnej
  • => Moduł do obliczania średniego kwadratu przesunięcia oraz współczynnika samodyfuzji, z możliwością prezentacji danych na wykresie
  • => Moduł do analizy radialnej funkcji rozkładu, z możliwością wyświetlania danych na wykresie
  • => Moduł do statystycznej analizy rozkładu wartości współrzędnych wewnętrznych, z możliwością wyświetlania wyników na wykresie
  • => Moduł do obliczania współczynników tensora sztywności/tensora sprężystości badanego materiału
  • => Moduł do trójwymiarowej analizy Voronoi lub równoważnej
  • => Możliwość obliczania przewodnictwa cieplnego materiałów      

Obsługiwane systemy licencjonowania:

  • Przypisana do sprzętu (hardware locked)
  • Przypisana do użytkownika (floating)

Galeria:

Licencja: 
Demo, Commercial
System: 
Windows, Linux, MacOS
Rozmiar: 
-- MB
Average: 5 (3 votes)

Dodaj Komentarz

Plain text

  • Dozwolone znaczniki HTML: <a> <em> <strong> <cite> <blockquote> <code> <ul> <ol> <li> <dl> <dt> <dd>
  • Adresy internetowe są automatycznie zamieniane w odnośniki, które można kliknąć.
  • Znaki końca linii i akapitu dodawane są automatycznie.
CAPTCHA
Poniższe zadanie ma na celu stwierdzenie, czy jesteś człowiekiem, a tym samym przeciwdziałanie spamowi.
6 + 9 =
Rozwiąż proszę powyższe zadanie matematyczne i wprowadź wynik.

Partnerzy Portalu

laboratoria.net

Rekomendowane Firmy

Notatek.pl - Materiały na studia: notatki, ćwiczenia, wykład

Laboratorium - Przegląd Ogólnopolski

Fiszkoteka