Visual Molecular Dynamics (en)

Program chemiczny Visual Molecular Dynamics
(fot. www.ks.uiuc.edu)

Visual Molecular Dynamics 1.9

VMD to program do modelowania, wizualizacji 3D i analizy systemów biologicznych, takich jak białka, kwasy nukleinowe, lipidy, itp. Może być również stosowany do przeglądania większości cząsteczek, a także do wizualizacji struktur molekuł zawartych w plikach PDB (Protein Data Bank).

Visual Molecular Dynamics oferuje szeroką gamę metod renderowania i kolorowania cząsteczki, może być wykorzystany do symulacji dynamiki molekularnej i analizy trajektorii.

Do głównych cech programu należą między innymi:

  • Wsparcie dla wszystkich głównych platform komputerowych ,
  • Wsparcie dla wielordzeniowych procesorów,
  • Wsparcie dla GPU dające przyspieszenie obliczeń ,
  • Wiele doskonałych samouczków,
  • Brak ograniczeń na liczbę cząsteczek, atomów, ilości klatek trajektorii,
  • Wiele metod renderingu i kolorowania czstek,
  • Możliwość wyświetlania cząstek w trybie stereo,
  • Szeroki wybór podzbiorów atomów do wyświetlania (w tym operatorów logicznych, wyrażeń regularnych, itp),
  • Wsparcie dla ponad 60 formatów plików cząsteczek i typów danych poprzez zastosowanie obszernej biblioteki,
  • Visual Molecular Dynamics zawiera wiele wtyczek rozszerzających możliwości programu,
  • Umożliwia eksport plików graficznych, które mogą następnie być przetwarzane przez wiele innych programów np.: POV-Ray, Rayshade, Raster3D, Tachyon.
Licencja
Freeware
System operacyjny
Windows, Linux, Mac OS X
Rozmiar pliku
22 MB

Partnerzy Portalu